西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。 仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用＜人造人＞士兵展开反攻作战。 然而无限增加的＜机械生物＞阻挡在前，战争陷入胶著状态。 作为最终兵器，人类派遣新型人造人＜寄叶＞部队至地球。刚被派往地球的＜2B＞与先行调查员＜9S＞会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……。 这是关于为人类而战，无生命＜人造人＞的故事－－ PS：Automata指的是“自动人形”，别再机械纪元求求了。
在异世生存十年的幸存者左天辰去回到了一切悲剧开始的那天； 外星生物入侵，携带细菌...
远在宇宙另一端的波波星人因为不堪忍受瓜星人的侵掠，于是举族远迁，将蔚蓝的地球视为他们新的定居点。在颟顸的领袖的指挥下，波波星人将人类驱逐到澳大利亚一处专门修建的定居点，还美其名曰与人类和平共处。绰号“小费”的女孩格莱图蒂•图奇是城市中唯一的落网者，她思念被抓走的母亲，于是带着爱猫驱车寻找母亲的下落。半路上小费遭遇了一名波波星人小欧，小欧是一个令同族人唯恐避之不及的麻烦所在，他不久前用手中的仪器发送了乔迁派对的邀请，谁知其中一条群发给了瓜星人，他由此被同类视作叛徒遭到追捕。 类似的遭遇让小费和小欧坐上同一辆车，他们由此踏上惊险的旅程，期间则得知瓜星人追逐波波星人的原因……
三眼国王要占领魔方市，失误将神奇能量道具散落各处，而皮皮鲁恰巧通过神奇能量道具意外闯入缩小玩具世界，重启冒险之旅！一场神奇能量带来的奇妙体验，一场重创三眼国王阴谋反击战拉开序幕！
